A diferencia de las Máquinas Técnicas o MT, las Máquinas Ocultas son reutilizables, aunque no es posible reemplazarlas con un movimiento nuevo. Cuando un Pokémon aprende una MO, ésta aparece como una nueva opción en el menú del Pokémon, ya que las Máquinas Ocultas tienen funciones especiales fuera del combate:

• Corte: Permite cortar arbustos que bloquean el camino
• Vuelo: Permite volar a los pueblos y ciudades visitadas.
• Surf: Permite subirte al Pokémon para atravesar el agua sobre él.
• Fuerza: Permite desplazar las rocas, al empujarlas el Pokémon.
• Destello: Ilumina una cueva oscura (Túnel Roca).