Para empezar a enfrentarte con el Alto Mando, habla primero con el chico que encontrarás al final del cinto. Antes de poder llegar a él, aparecerá tu rival de nuevo, esta vez retándote a un último combate. Recuerda haber curado a tus Pokémon antes de eso.

Entrenador	1º Pokémon	2º Pokémon	3º Pokémon	4º Pokémon	5º Pokémon	6º Pokémon
Rival, 5100¥	Staraptor Nv.48	Rapidash Nv.47	Torterra Nv.51	Floatzel Nv.47	Heracross Nv.48	Snorlax Nv.49
Rival, 5100¥	Staraptor Nv.48	Roserade Nv.47	Infernape Nv.51	Floatzel Nv.47	Heracross Nv.48	Snorlax Nv.49
Rival, 5100¥	Staraptor Nv.48	Rapidash Nv.47	Empoleon Nv.51	Roserade Nv.47	Heracross Nv.48	Snorlax Nv.49

Liga Pokémon
Tentacruel Nv. 30/50	Magikarp Nv. 3/25	Gyarados Nv. 30/55	Remoraid Nv. 10/25
Octillery Nv. 30/55	Wingull Nv. 30/40	Pelipper Nv. 30/50	Luvdisc Nv. 20/30

Tras haber vencido a tu Rival, cura de nuevo a tus Pokémon y vuelve a hablar con el que está cubriendo la entrada. Tras comprobar que tienes las 8 medallas, te dejará pasar. Tu primer adversario del Alto Mando será Alecrán, que usará Pokémon de tipo Bicho. Usa Pokémon de tipos Fuego o Volador para vencerlos.

Entrenador	1º Pokémon	2º Pokémon	3º Pokémon	4º Pokémon	5º Pokémon
Alecrán, 6360¥	Yanmega Nv.49	Heracross Nv.51	Vespiquen Nv.50	Scizor Nv.49	Drapion Nv.53

Tras terminar con Alecrán dirígete a la siguiente sala, donde te encontrarás con Gaia. Gaia usará Pokémon de tipo Tierra, por lo que será débil contra los tipos Planta, Agua y Hielo. Al igual que Alecrán, todos los demás miembros del Alto Mando usan 5 Pokémon.

Entrenador	1º Pokémon	2º Pokémon	3º Pokémon	4º Pokémon	5º Pokémon
Gaia, 6600¥	Whiscash Nv.50	Hippowdon Nv.52	Gliscor Nv.53	Golem Nv.52	Rhyperior Nv.55

El siguiente adversario será Fausto, con el que ya te has encontrado antes, en Ciudad Marina. Éste 3er miembro del Alto Mando usará Pokémon de Tipo Fuego, débiles contra los tipos Agua, Roca y Tierra.

Entrenador	1º Pokémon	2º Pokémon	3º Pokémon	4º Pokémon	5º Pokémon
Fausto, 6840¥	Houndoom Nv.52	Infernape Nv.55	Magmortar Nv.57	Flareon Nv.55	Rapidash Nv.53

Finalmente, ahora te tocará el último y más fuerte miembro del Alto Mando, tras el cual viene la Campeona. Delos usará Pokémon de tipo Psíquico, a los que vencen los tipos Bicho, Fantasma y Siniestro. Tras haber vencido, cura a tus Pokémon y sigue el camino hasta llegar a la siguiente sala.

Entrenador	1º Pokémon	2º Pokémon	3º Pokémon	4º Pokémon	5º Pokémon
Delos, 7080¥	Mr. Mime Nv.53	Gallade Nv.59	Alakazam Nv.56	Bronzong Nv.54	Espeon Nv.55

Ahora, llegarás a la sala de la Campeona, la cual es Cintia. Tras eso, empezará tu combate con ella. Cynthia, a diferencia del Alto Mando, tiene 6 Pokémon, y sus niveles son mayores, por lo que asegúrate de haber preparado lo posible a tus Pokémon.

Entrenador	1º Pokémon	2º Pokémon	3º Pokémon	4º Pokémon	5º Pokémon	6º Pokémon
Cintia, 12400¥	Spiritomb Nv.58	Garchomp Nv.62	Milotic Nv.58	Togekiss Nv.60	Roserade Nv.58	Lucario Nv.60

Tras haber vencido a Cintia, ésta te llevará hacia el Hall de la Fama. Aparecerá también el Profesor Serbal, felicitándote por tu victoria. Ahora, tus Pokémon aparecerán registrados uno a uno, tras lo cual aparecerán los créditos del juego y se guardará la partida.